Фамилия Есенкабулов происходит от сложного казахского имени Есенкабул. Как и многие восточные имена, оно составное. Первая часть, «Есен», с казахского переводится как «благополучный, здоровый». Вторая, «Кабул», — имя тюркского происхождения, восходящее к арабскому слову со значением «приём, аудиенция, встреча» или «выражение согласия». Соединяя эти смыслы, имя Есенкабул можно истолковать как «благополучно принятый» или «здоровый и желанный». Родители, давая такое имя, желали сыну крепкого здоровья, высокого положения в обществе и счастливой судьбы.

Фамилия образована по привычной для русской традиции модели: к основе имени Есенкабул добавили патронимический суффикс -ов. Такой способ — самый распространённый для адаптации тюркских имён в русской среде. Суффикс -ов указывает на принадлежность: буквально Есенкабулов — это «сын (или потомок) Есенкабула». Со временем эта форма закрепилась как наследственная фамилия.

Стоит обратить внимание на редкость такой модели. В казахской ономастике фамилии чаще образуются с помощью суффиксов -улы, -кызы или вовсе без них. Форма с русским -ов говорит о том, что фамилия закрепилась в период активного взаимодействия казахской и русской культур, скорее всего, в XIX–XX веках, когда многие казахские роды получали официальные документы и фамилии по русскому образцу.