Фамилия Есиналин — одна из тех, где за привычным русским окончанием скрывается тюркская основа. Её ядро — имя Есинал. Это составное имя, распространённое у казахов и других тюркских народов. Первая часть, «Еси» (или «Ес»), восходит к слову «ес» — память, разум, сознание. Вторая часть, «нал», может быть вариантом арабского «нал» — дар, получение, или же тюркского «налы» — страдание, мука. В зависимости от того, какой смысл вкладывали родители, имя Есинал могло означать либо «дарованный разумом», «память как дар», либо, что менее вероятно, «терпеливый, познавший страдания».

В русском языке фамилия образовалась по типичной модели: к тюркскому имени Есинал добавили русский патронимический суффикс -ин. Суффикс -ин, в отличие от -ов, обычно присоединялся к основам, оканчивающимся на гласный или мягкий согласный. Так, Есиналин буквально означает «сын Есинала», «принадлежащий Есиналу». Это указывает на то, что предок носителя фамилии носил это имя, а сама фамилия закрепилась, скорее всего, в среде казахов или других тюркских народов, вошедших в состав Российской империи и получивших русские фамилии при переписях или оформлении документов.

Географически фамилия Есиналин привязана к Казахстану и прилегающим регионам России. По данным современных справочников, наибольшая концентрация носителей — в Западно-Казахстанской, Атырауской и Актюбинской областях Казахстана, а также в Оренбургской и Астраханской областях России. Это зона расселения казахов Младшего жуза, где подобные фамилии на -ин не редкость.

В отличие от многих русских фамилий, где суффикс -ин образует «матронимы» (от женских имён, например, Марьин), здесь он работает с мужским тюркским именем. Поэтому версия о происхождении от прозвища «Есиналя» (какого-то конкретного человека) менее вероятна, чем прямая связь с личным именем. Фамилия не имеет отношения к слову «есина» (в русском языке такого слова нет) и не является вариантом фамилии Есин или Есенин — у них другая, славянская, основа.