Фамилия Естаков — один из примеров того, как простое прозвище или местное имя превратилось в устойчивую родовую подпись. В её основе лежит тюркское или арабское имя Естак (Истак, Астак), которое через суффикс -ов закрепилось в русской ономастике. Суффикс указывает на принадлежность: Естаков буквально значит «сын Естака» или «потомок Естака». Само имя Естак, скорее всего, восходит к арабскому «астак» — «прочный», «крепкий», либо к тюркскому прозвищу со значением «упрямый», «настойчивый». В любом случае, прозвище давали человеку с твёрдым характером.

Географически фамилия привязана к югу России и Поволжью — регионам, где веками соседствовали русские и тюркские народы. В документах XVII–XVIII веков Естаковы встречаются среди служилых людей, казаков и крестьян Астраханской, Саратовской и Оренбургской губерний. Это не случайно: именно там оседали выходцы из татарской и башкирской среды, принимавшие православие и менявшие фамилии на русский лад. Естаков мог быть потомком крещёного татарина или башкира, получившего фамилию по отцу.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «естак» (истак), которое в некоторых говорах означало «небольшой сундук» или «ларь». Тогда прозвище Естак давали сундучнику — мастеру, делавшему деревянные короба. Однако эта гипотеза уступает антропонимической: в русской традиции фамилии от названий предметов редко образовывались напрямую без уменьшительного суффикса.

Сегодня фамилия Естаков остаётся немногочисленной, но устойчивой. Её носители живут в основном в Поволжье, на Урале и в Сибири — там, куда мигрировали казачьи и крестьянские семьи. По написанию фамилия не менялась: в дореволюционных метриках она фиксировалась как Естаковъ, с буквой «ять» в корне, что подтверждает её стабильную форму. В отличие от однокоренных Естаковских или Естакенко, суффикс -ов указывает на великорусское, а не украинское или польское происхождение.