Фамилия Эцин — одна из тех, что ставит исследователя в тупик своей краткостью. В ней нет привычных для русских фамилий суффиксов -ов, -ин или -ский, а корень «Эц-» звучит нетипично для славянских языков. Из-за этого сразу возникают две основные версии происхождения, и обе ведут в разные культурные миры.

Первая и самая вероятная версия — еврейская. В ашкеназской традиции фамилии нередко образовывались от аббревиатур или библейских имён. «Эцин» может быть вариантом фамилии Этцин (Etzin), которая восходит к ивритскому слову «эц» (עץ) — «дерево». В таком случае фамилия могла означать «сын дерева» или быть прозвищем человека, связанного с лесным ремеслом — плотника, столяра. Альтернативно, это могла быть искусственная фамилия, данная при переписи в Российской империи или Австро-Венгрии, когда чиновники сокращали длинные еврейские фамилии до более коротких форм. Фамилия Эцин встречается в документах XIX века на территории черты оседлости, особенно в Волынской и Подольской губерниях.

Вторая версия — тюркская или кавказская. В языках тюркской группы «эц» или «эс» может означать «память», «след» или «хозяин». Фамилия могла образоваться от прозвища Эци, которое давали человеку с хорошей памятью или хранителю традиций. Однако эта гипотеза слабее: в тюркских фамилиях на территории России чаще встречаются суффиксы -ов, -ев, -оглы, а форма Эцин без них — редкость. Поэтому основным кандидатом остаётся еврейский корень.

С точки зрения словообразования, фамилия Эцин могла быть оформлена по русской модели через суффикс -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Эцин. Если основа Эц — это личное имя или прозвище, то фамилия буквально означает «сын (или потомок) Эца». В отличие от фамилий на -ов (которые чаще давались по профессии или отцу), -ин мог указывать на более личную, семейную связь.

География фамилии сегодня размыта: Эцины встречаются в России, Украине, Израиле и США. В дореволюционных записях по метрическим книгам Киевской губернии можно найти упоминания купцов и мещан с этой фамилией. Сословная принадлежность была разной — от ремесленников до мелких торговцев.

Короткая фамилия в один корень часто говорит о том, что её носители не были частью дворянства или духовенства: такие фамилии обычно закреплялись за простыми людьми поздно, в XIX веке, при введении всеобщей паспортизации. Эцин — редкий пример, где за четырьмя буквами скрывается либо библейская символика дерева, либо канцелярское сокращение, но в любом случае — история миграции и адаптации.