Фамилия Фабиев — редкий пример, когда русская по форме фамилия почти наверняка имеет нерусское, итальянское происхождение. Основа здесь — личное имя Фабий (лат. Fabius), принадлежавшее знатному римскому роду. В русском языке это имя встречалось в среде духовенства и дворянства, но массовым никогда не было. Фамилию образовали по стандартной модели: к основе на -ий добавили русский патронимический суффикс -ев, что буквально означает «сын Фабия».

Версия о происхождении от прозвища или профессии маловероятна. Слово «фабий» в русских говорах не зафиксировано, а попытки связать фамилию с латинским faber («кузнец») наталкиваются на то, что в таком случае форма была бы Фаберов. Унбегаун в «Русских фамилиях» отмечает, что фамилии на базе латинских и греческих имён — типичный признак семинарского происхождения. Священники и их дети нередко получали «благозвучные» фамилии по именам античных героев или святых (святой Фабий, папа римский III века, почитается в католичестве).

Фамилия крайне редкая. В современных базах данных она фиксируется единично, преимущественно на юге России и в Закавказье, что может указывать на позднее появление — возможно, в результате русификации итальянской фамилии Fabi или Fabio. В таком случае носитель или его предок был выходцем из Италии, а окончание переделали на русский лад.

Словообразовательно фамилия проста: корень Фаби- и суффикс -ев. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Фа́биев.