Фамилия Фафакин — редкий случай, когда основа говорит сама за себя, но понять её не так просто. В центре — звукоподражательное или детское слово «фафа». В русских говорах так называли заикающегося человека, того, кто говорит с запинкой, «фафакает». Прозвище Фафака или Фафань давали тому, кто картавил, шепелявил или просто имел невнятную речь. Это не оскорбление, а бытовая характеристика, как Косой или Хромой.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Фафакин. Модель образования типична для русских фамилий от прозвищ на -а, -я: Фафака → Фафакин. То есть предок носителя фамилии был известен в округе как Фафака — человек с дефектом речи.

Есть и другая, менее очевидная версия. В рязанских и тамбовских говорах «фафа» — это просторечное, почти детское обозначение еды, каши. Прозвище Фафа могли дать любителю поесть или тому, кто кормил других, например, работнику при трапезе. Но эта гипотеза слабее: основное значение слова «фафакать» в русских диалектах прочно связано с речью, а не с едой.

Фамилия очень редкая. Встречается в основном в центральных областях России, но без выраженного гнезда. В дореволюционных списках Фафакины — почти всегда крестьяне или мещане, без дворянских корней. Унбегаун в «Русских фамилиях» не упоминает эту фамилию, что тоже говорит о её локальности и нечастотности: она не попала в общерусский свод.

Сравните с однокоренными: Фафанов, Фафурин, Фафонов — все они построены от тех же звукоподражательных основ. Но Фафакин стоит особняком благодаря суффиксу -ин, который в этом ряду встречается реже. Если вы встретили Фафакина, перед вами потомок человека с прозвищем заики или картавого — прозвищем, которое закрепилось за родом навсегда.