Фамилия Факушин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если бросить взгляд на суффикс, бросается в глаза нестандартная модель: окончание -ин обычно крепится к основам на -а/-я (Иван — Иванов, но Ивашин — от Иваша). Здесь же основа Факуш-, и суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Факушин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Факуша.

Что могло значить это прозвище? Самая прямая версия — от слова «факус» или «факуша», которое в русских говорах могло быть искажением или диалектным вариантом. В словаре Даля зафиксировано слово «факус» — так в некоторых областях называли хитреца, пройдоху или льстеца, человека с ужимками. Если это так, то Факуша — прозвище по характеру, возможно, с оттенком насмешки или уважительной оценки ушлого, ловкого человека.

Вторая, менее очевидная версия — связь с тюркскими языками. В татарском и башкирском есть имя Факуш или Факиш (от арабского корня со значением «понимающий», «смышленый»). В Поволжье и на Урале, где русские и тюркские фамилии нередко смешивались, прозвище Факуша могло возникнуть от такого имени, а затем оформиться по русской модели на -ин. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия Факушин встречается в основном в регионах с татарским влиянием — например, в Башкортостане и Оренбуржье.

Фамилия недворянская, скорее всего крестьянская или мещанская. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она попадается редко, что подтверждает её локальный и нераспространённый характер. Носители фамилии, по всей видимости, были людьми простого звания — земледельцами или ремесленниками, а прозвище передалось по наследству как родовое имя.

Итог: Факушин — фамилия, образованная от прозвища или личного имени Факуша, которое могло означать либо хитреца (из русских говоров), либо смышлёного человека (из тюркского). Точный корень определить сложно, но наиболее вероятна именно тюркская основа с последующей русификацией.