Фамилия Фандофан — редкий случай в русской ономастике, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянскими корнями. Первое, что бросается в глаза, — это её структура: повторяющийся слог «фан» и отсутствие типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Это сразу подсказывает, что перед нами не фамилия, образованная по стандартной модели от прозвища или имени, а скорее всего, иноязычное заимствование.

Наиболее правдоподобная версия — французское происхождение. Фамилия могла возникнуть от французского выражения «fand’ofan» — искажённого «fendre à vent» (буквально «рассекать ветер») или, что более вероятно, от составного прозвища вроде «fand’o’vent» (что-то вроде «ветрогон», «вертопрах»). В русском языке такие фамилии нередко появлялись у обрусевших французов, гувернёров, военных или ремесленников, осевших в России в XVIII–XIX веках. В пользу этой версии говорит и характерное для французских фамилий окончание на «-ан» (ср. Фабр, Дефан) и необычная для русского уха двойная «ф».

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает Фандофан с итальянским диалектом. В некоторых областях Италии «fando fano» могло означать «делающий дело» или «работающий спустя рукава» — в зависимости от диалекта. Однако эта версия слабее, так как массовой итальянской миграции в Россию в те времена не было, а единичные случаи не могли породить устойчивую фамилию.

Суффикса в привычном русском смысле у фамилии нет: она не склонялась по падежам как типичная русская (Фандофан — Фандофану — Фандофаном), а оставалась неизменяемой, что тоже указывает на её иноязычное происхождение. В документах XIX века встречаются варианты написания: Фандофан, Фандофанъ и даже Фандо-Фан, что подтверждает попытки адаптировать иностранное слово к русской графике.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был невысоким: это могли быть мелкие чиновники, военные нижних чинов или городские ремесленники. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована, что говорит об её простонародном или мещанском происхождении. Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в центральных губерниях России, что косвенно подтверждает версию о единичном переселенце, давшем начало небольшому роду.

Таким образом, Фандофан — это, вероятно, русифицированная французская фамилия, означавшая когда-то прозвище вроде «ветрогон» или «легкомысленный человек». Её редкость и необычное звучание делают её своеобразным маркером истории: каждый носитель этой фамилии — потомок человека, который когда-то принёс в русскую речь кусочек французского быта.