Фамилия Фазлутов — яркий пример того, как русская фамилия вобрала в себя восточное имя. Её основа — мужское личное имя Фазлут, которое в свою очередь восходит к арабскому «Фазл» (فضل) — «достоинство», «превосходство», «щедрость». Форма на -ут (Фазлут) характерна для тюркских языков, где она часто служит ласкательным или уменьшительным вариантом. Таким образом, имя Фазлут можно перевести как «драгоценный», «одарённый» или «тот, кто обладает достоинством».

Русский суффикс -ов превращает восточное имя в фамилию по стандартной модели: «чей?» — Фазлутов, то есть сын Фазлута. Такие фамилии массово возникали в XVI–XIX веках при переходе тюркских и арабо-персидских имён в русскую антропонимию, особенно в среде служилых татар, башкир, а также крещёных народов Поволжья. Фамилия нередко встречается у татар, башкир и в среде мусульманского духовенства, где имя Фазл было распространено.

Интересная деталь: в дореволюционных записях фамилия могла писаться как Фазлуттов — с двойной «т», что указывает на прямое заимствование без адаптации к русскому произношению. Современный вариант с одной «т» — результат упрощения, которое закрепилось в XX веке. Сословно предки Фазлутовых скорее всего были крестьянами или мещанами, но не исключено, что основатель рода был муллой или торговцем, так как имя Фазл было популярно среди образованных слоёв.

Других версий происхождения, например от славянского корня, у фамилии нет: это стопроцентный арабско-тюркский след, переоформленный по-русски.