Фамилия Фелифоров — редкий случай, когда основа почти наверняка ведёт не в славянские, а в греческие или латинские корни, но через церковную книгу. В её основе лежит каноническое имя Фелифор, которое в святцах встречается в форме Филипп? Нет, здесь другая история.

Имя Фелифор — это русская народная переработка греческого имени Феофилакт (Theophylaktos), что значит «хранимый Богом». В просторечии длинное и непривычное для слуха Феофилакт превращалось в более удобные формы — Феликс, Филя, а в некоторых говорах и в Фелифора. Звуковой сдвиг простой: «фео» перешло в «фе», «филакт» сократился и упростился до «фор». Подтверждение этому — существование параллельных фамилий Феофилактов, Филиппов (от другого корня) и Феликсов, но Фелифоров стоит особняком, прямо указывая на конкретный вариант имени.

Фамилия образована по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ов: Фелифор → Фелифоров, то есть «сын Фелифора». Такое окончание характерно для фамилий, возникших в центральных и северных областях России, где -ов доминировал над -ин. В южных и западных регионах скорее появился бы Фелифоренко, а в белорусских землях — Фелифорович.

Носитель фамилии Фелифоров, скорее всего, потомок человека, которого в документах записали простонародной формой крестильного имени. Это указывает на среду, где имя давали по святцам, но в быту переделывали на свой лад. Сословно предки могли быть крестьянами, мещанами или духовенством — в среде священнослужителей такие книжные, но изменённые имена встречались часто.

География фамилии неширокая. Встречается она преимущественно в Центральной России и Поволжье, единичные случаи — на Урале. Редкость фамилии (по разным подсчётам, не более нескольких сотен носителей) говорит о том, что родословная, скорее всего, восходит к одному или нескольким локальным родам, а не к массовому расселению.