Фамилия Фиалковский звучит нарочито книжно, и это не случайно: скорее всего, перед нами типичная семинарская фамилия. В духовных училищах России XVIII–XIX веков будущим священникам часто давали «благозвучные» фамилии, образованные от названий растений, цветов или церковных понятий. Так появились целые пласты фамилий — Розановы, Туберозовы, Гиацинтовы и, вероятно, Фиалковские. Искусственное происхождение здесь даже более правдоподобно, чем бытование фамилии в крестьянской среде.

Однако если копнуть глубже, у фамилии есть и другая, более архаичная основа — мирское имя Фиалковый. В древности, до повсеместного распространения христианских календарных имен, на Руси давали имена от названий растений, животных и явлений природы. Имя Фиалковый образовано от названия травянистого растения с фиолетовыми, желтыми, белыми или разноцветными цветками — фиалки. Давая младенцу такое имя, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это растение. Считалось, что имя-оберег защищает человека и связывает его с силами земли.

Есть и третья версия, связанная с календарным циклом. Возможно, имя Фиалковый давали ребенку, рожденному летом. Еще во времена язычества фиалка считалась символом лета. Известен старинный обычай: когда люди обнаруживали первую фиалку, вся деревня сбегалась на указанное место, цветок поднимали на шест, а вокруг него танцевали, резвились и пели веселые песни. Так крестьяне символически «находили лето». Ребенок, появившийся на свет в эту пору, получал имя, напоминающее о тепле и пробуждении природы.

Суффикс -ский в фамилии Фиалковский указывает на модель образования, типичную для польской и украинской шляхты, а также для русских дворянских и духовных фамилий. Он отвечает на вопрос «из какой местности?» или «чей?», но в данном случае скорее подчеркивает принадлежность к роду человека по имени Фиалковый. Потомок того, кто носил мирское имя Фиалковый, со временем получил фамилию Фиалковский.

Стоит отметить, что фамилия эта довольно редкая. Встречается она преимущественно у потомков духовенства, а также среди поляков и украинцев, где форма Фиалковский (Fiałkowski) бытует естественно и давно. В польском языке фамилия пишется через «Fiałkowski» и связана с тем же корнем — «fiołek», то есть фиалка. Так что перед нами редкий случай, когда и народная, и книжная традиции сходятся в одной точке, давая фамилии двойное дно: и древнее, языческое, и позднее, семинарское.