Фамилия Филимоненков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Филимоненков послужило церковное имя Филимон. Фамилия Филимоненков образована от крестильного имени Филимон. Суффикс –енко указывает на то, что фамилия Филимоненков складывалась под украинским влиянием. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филимон, со временем получил фамилию Филимоненков. О точном месте и времени возникновения фамилии Филимоненков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Филимоненков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.