Фамилия Филимоново — редкий случай, когда перед нами не мужская, а средняя форма, указывающая на происхождение от названия населённого пункта. В русской ономастике фамилии на -ово, -ино (Дурово, Болдино, Филимоново) традиционно закреплялись за дворянскими родами, владевшими одноимёнными поместьями. Однако Филимоново могла возникнуть и у простых крестьян, которых записали по месту жительства: «Иван из Филимонова» со временем сам стал Филимоново. Такая модель образования фамилии характерна для центральных и северных губерний России, где топонимы на -ово особенно распространены.

Основа фамилии — имя Филимон, греческого происхождения (phileo — «любить»). В святцах это имя носил ученик апостола Павла, поэтому на Руси его давали при крещении достаточно часто. От имени Филимон образовалась масса фамилий: Филимонов, Филимонихин, Филимонычев. Форма Филимоново стоит особняком — она не просто отчественная, а топонимическая, то есть восходит к названию деревни или села.

Интересно, что в современной России фамилия Филимоново встречается крайне редко — в основном как пережиток старой записи. В XIX веке крестьянам нередко давали фамилии по названию деревни, откуда они вышли, и если деревня именовалась Филимоново (по имени первопоселенца Филимона), то и фамилия закреплялась в той же форме. Сейчас такие фамилии чаще воспринимаются как ошибки писцов или как указание на женский род, но исторически это полноценная мужская фамилия, склоняемая по правилам прилагательного: «у Ивана Филимонова», «к Петру Филимонову».

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Филимоново — самая редкая. Филимоновых по России десятки тысяч, а Филимоново — единицы, сосредоточенные в основном в Костромской и Вологодской областях, где сохранились старые топонимы. Это не фамилия, а прямой географический маркер: предки носителя жили в деревне, названной в честь крещёного человека по имени Филимон. Никаких иных прозвищ или профессий за этой формой не стоит — только имя и место.