Фамилия Филимонюк относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Филимон. Мужское крестильное имя Филимон имеет древнегреческое происхождение и означает «любимый». Покровителем этого имени считается святой мученик Филимон, живший в IV веке. Филимон в числе других девяти мучеников обличал язычников и проповедовал веру Христову, за что после мучений был обезглавлен. Поэтому Филимонюк буквально понималось как «сын Филимона».