Фамилия Фисина — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с внешностью или характером. Если отбросить суффикс -ин, который в русских фамилиях означает «чей?» (чей сын? чья дочь?), остаётся корень Фис-.

Самая прямая версия отсылает к слову «фис» — так в некоторых южных и западных говорах называли хорька. В переносном смысле «фисой» могли прозвать хитрого, юркого или нелюдимого человека, который «всё чует» и ускользает от беды. Прозвище Фиса, а от него и фамилия Фисин/Фисина, хорошо ложится на модель образования, знакомую по фамилиям Лиса, Волков, Ежов: человека называли по звериной черте.

Есть и вторая, менее очевидная гипотеза. В некоторых диалектах «фиса» означало «фисташка» или «мелкий орешек» — так могли дразнить невысокого, щуплого человека. Однако эта версия слабее: слово «фиса» в значении «орех» встречается редко и локально, тогда как «фис»-хорёк зафиксирован в словарях народных говоров.

Суффикс -ин указывает на то, что фамилия закрепилась в среде, где детей называли по отцу: сын Фиси — Фисин, дочь Фиси — Фисина. Судя по окончанию, носительница фамилии — женщина, а мужской вариант выглядел бы как Фисин. Встречаемость фамилии крайне низкая, и география её бытования тяготеет к югу России и украинским областям, где слово «фис» было в ходу.

Интересно, что фамилия Фисина не связана ни с греческим корнем (вопреки возможной ассоциации с «физис» — природа), ни с фамилией Фисин, которая иногда возникает как искажённое Фишкин (от имени Фишель). Здесь перед нами чистый пример народной ономастики: прозвище по животному, которое со временем стало фамилией.