Фамилия Фокаф — редкий случай, когда написание говорит больше, чем звучание. На слух это «Фокаф», но по правилам русской орфографии фамилии, оканчивающиеся на -ов, в именительном падеже мужского рода пишутся через -ов, а не -аф. Форма «Фокаф» — это не опечатка, а возможное отражение живого произношения или, что вероятнее, фиксация фамилии по документам, где «в» на конце оглушили и записали как «ф». Такое встречается в южнорусских говорах и в записях, сделанных малограмотными писарями.

Основа фамилии — каноническое мужское имя Фока (от греческого «фокос» — тюлень). В святцах это имя носили несколько раннехристианских мучеников, и на Руси оно было распространено, хоть и не так часто, как Иван или Пётр. От имени Фока образовали типичную патронимическую фамилию: «чей?» — Фоков, то есть сын Фоки. Форма «Фокаф» — это тот же Фоков, но записанный на слух.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: предок носителя фамилии был человеком по имени Фока. Это самая массовая модель русских фамилий, но в данном случае интересно не происхождение, а написание. Если бы фамилия была записана правильно, она бы ничем не выделялась среди тысяч других на -ов. А вот редкий вариант с «ф» на конце делает её загадкой для генеалога: по одной записи можно подумать, что это иноязычная фамилия, но на деле — чисто русская, просто зафиксированная с диалектной особенностью.

Географически фамилия Фокаф (и её нормативная версия Фоков) встречается в регионах, где было развито устное, а не письменное закрепление фамилий: в казачьих областях, на юге России, а также среди крестьян, получивших фамилии после отмены крепостного права и записанных со слов. В таких записях «Фокаф» — норма, а не ошибка.