Фамилия Фомишкие — редкий случай, когда географическая привязка и модель образования расходятся с привычными русскими схемами. Основа здесь, скорее всего, та же, что у массовой фамилии Фомин — от канонического имени Фома (апостол, «близнец»). Но суффикс -ишк- указывает не на отчество, а на прозвище или уменьшительную форму: Фомишка — «маленький Фома», возможно, с пренебрежительным или ласкательным оттенком. А окончание -ие — не русское, а польское или белорусское, характерное для фамилий на -ский/-цкий. Получается, что Фомишкие — это «люди из рода Фомишки» или «те, кто живёт у Фомишки».

Такая модель типична для западных регионов бывшей Речи Посполитой: современные Беларусь, Литва, восточная Польша. Там фамилии на -ский часто указывали на дворянское или шляхетское происхождение, но не обязательно: крестьяне и мещане тоже могли получить такую форму по названию усадьбы или хутора. Если предки Фомишких действительно носили прозвище Фомишка, то фамилия могла возникнуть как «Фомишкин» (с русским суффингом -ин), но под влиянием польской письменной традиции превратилась в «Фомишкие» — множественное число, характерное для обозначения семьи или рода.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В современных базах данных она почти не фиксируется, что говорит либо о её угасании, либо о сильном искажении при записи (например, могли путать с Фомишкин или Фомицкий). Споров о происхождении почти нет: версия с именем Фома и польским суффиксом — единственная правдоподобная. Альтернатива (от литовского корня) слаба, так как в литовском нет близкого по звучанию слова с таким значением.

Таким образом, Фомишкие — это фамилия-маркер: она выдаёт в своих носителях потомков выходцев из западнорусских земель, где православное имя Фома получило местную огласовку и суффиксальное оформление. Если вы ищете свои корни, стоит обратить внимание на Гродненскую или Витебскую губернии, а также на метрические записи костёлов и униатских церквей — там фамилия могла сохраниться в первоначальном виде.