Фамилия Фруктов — яркий пример так называемой искусственной, или семинарской, фамилии. Такие фамилии не складывались веками в крестьянской или боярской среде, а целенаправленно присваивались учащимся духовных училищ и семинарий. Чаще всего это происходило потому, что у будущего священника не было родового прозвища, или же оно казалось начальству неблагозвучным. Тогда наставники давали ученику новое имя, руководствуясь самыми разными источниками: именами святых, античных богов, названиями городов, драгоценных камней, экзотических животных и растений.

Семинаристы даже сложили шутливую формулу, описывающую принцип выбора: «По церквам, по цветам, по камням, по скотам, и яко восхощет его преосвященство». Эта присказка точно отражает пестроту и порой неожиданность таких именований. Среди искусственных фамилий особенно велика доля «растительных». Однако здесь есть любопытная деталь. Чаще всего за основу брали конкретный вид: Тюльпанов, Фиалков, Абрикосов. Фамилия же Фруктов пошла от родового, обобщающего понятия — от слова «фрукт». Это роднит её с такими фамилиями, как Цветков или Деревов, которые также образованы не от единичного названия, а от целой категории.

Таким образом, перед нами не прозвище, данное за характер или внешность, а книжное, «кабинетное» творение. Версия о том, что предок носителя фамилии в быту звался Фруктом, маловероятна: в народной среде такое прозвище звучало бы иронично и вряд ли закрепилось. Гораздо правдоподобнее, что фамилию Фруктов придумали в стенах учебного заведения, следуя моде на «вкусные» и «ботанические» фамилии. В итоге потомок человека, получившего такое имя при поступлении в семинарию, со временем и стал носить фамилию Фруктов.