Фамилия Фрышко — редкий пример фамилии, образованной не от канонического крестильного имени, а от западноевропейского или польского прозвища. Основа «Фрыш» восходит к польскому świeży (свежий) или немецкому frisch (свежий, бодрый). В старопольском языке слово «frysz» означало «проворный», «бойкий», а также могло быть прозвищем молодого, неопытного человека. Таким образом, первый носитель фамилии — Фрыш — получил прозвище по характеру или возрасту.

Суффикс -ко характерен для украинских, белорусских и южнорусских фамилий, особенно на западе бывшей Речи Посполитой. Он указывает на уменьшительно-ласкательную форму или на происхождение от отца: Фрышко — «сын Фрыша» или «маленький Фрыш». Если бы фамилия закрепилась в великорусских землях, она скорее приняла бы форму Фрышев или Фрышкин. Форма на -ко выдает западнославянское или малороссийское происхождение.

Встречаемость фамилии Фрышко крайне низкая. По данным переписей, основная масса носителей сосредоточена на западе Украины (Львовская, Волынская области) и в Польше. В России фамилия единична. Это говорит о том, что предки носителей были выходцами из пограничных регионов, где смешивались польская, украинская и белорусская языковые стихии.

Возможна и вторая, менее вероятная версия: от немецкого слова Frisch как указания на профессию. В южнонемецких диалектах Frisch означало не только «свежий», но и «винокур» (тот, кто гнал свежий самогон). Если предок был переселенцем из немецких колоний в Галиции или на Волыни, прозвище могло перейти в фамилию через местную славянскую среду. Однако польская основа выглядит убедительнее из-за типичного для польской ономастики суффикса -ko.

Фамилия Фрышко не имеет отношения к русским дворянским родам, не встречается в старых боярских списках. Это фамилия крестьянского или мещанского сословия, которая закрепилась в XIX веке при паспортизации населения на западе Российской империи.