Фамилия Фунтиков напрямую связана с прозвищем Фунтик, которое носил её родоначальник. Само слово «фунтик» — это уменьшительная форма от «фунт», старинной меры веса, равной 96 золотникам или примерно 409,5 грамма. В народной речи это слово закрепилось за небольшим предметом или ёмкостью, отсюда и пошло прозвище.

Чаще всего прозвище Фунтик давали человеку невысокого роста, но плотного, коренастого сложения. Такое сравнение с увесистым, но компактным предметом было точным и метким. Впрочем, в некоторых говорах прозвище могло иметь и ироничный оттенок, указывая на незначительность или приземистость. Суффикс -ик в прозвище смягчал значение, делая его скорее ласкательным, чем обидным.

Существует и другая, более редкая версия, уходящая корнями в историю старообрядчества. В восточно-сибирских говорах бытовало выражение «фунтиков толк», которое обозначало одно из согласий беспоповщины. Если предок принадлежал к этому течению или просто был известен как приверженец старой веры, прозвище Фунтик могло закрепиться за ним по религиозному признаку. Эта гипотеза менее распространена, но имеет право на существование, особенно если учесть, что фамилия встречается в Зауралье и Сибири.

Сама фамилия образована по классической русской модели: к основе Фунтик добавился патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность к отцу. Изначально Фунтиков означало «сын Фунтика», а затем закрепилось как наследственная фамилия. Поскольку суффикс -ов характерен для центральных и северных регионов России, основная масса носителей фамилии живёт в Поволжье и на Урале, откуда фамилия впоследствии распространилась по всей стране.