Фамилия Фунтокин — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по стандартной русской модели: к основе Фунток- добавлен патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Фунтока). Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Фунто́кин.

Ключевой вопрос — что означает прозвище или некалендарное имя Фунток. Скорее всего, это производное от слова «фунт» — старинной русской меры веса (около 410 граммов). В диалектах и бытовой речи «фунтом» могли называть мелкую гирю, а «фунток» — человека невысокого, плотного или прижимистого, «тяжелого на подъем». В некоторых говорах слово «фунт» имело переносное значение: так дразнили скупого, который «каждый фунт считает». Таким образом, Фунток — прозвище по характеру или внешности, а Фунтокин — «потомок Фунтока».

Вторая, менее вероятная версия — связь с тюркскими языками. В ряде тюркских наречий «фунт» или близкие звучания означают «пятно», «крапинка» (ср. татарское «фунт» — родинка). Однако для центральной России, где фамилия встречается единично, эта этимология спорна. Словарь Б. Унбегауна не фиксирует фамилию, что подтверждает её редкость.

Географически Фунтокины, судя по данным переписей и телефонных справочников, встречаются в основном в Поволжье и на Урале — в Пермском крае, Кировской области, Татарстане. Это регионы, где смешивались русские и тюркские традиции прозвищ, но форма на -ин указывает на русское происхождение. Сословно, вероятнее всего, это крестьянская или мещанская фамилия: прозвища, связанные с бытовыми предметами и мерами, давали в среде, где ценили практичность и точность.

Особенность фамилии — её уникальность. В отличие от распространённых Фунтовых или Фунтиковых, Фунтокин почти не встречается в исторических документах. Это значит, что род мог быть малочисленным или основа прозвища была узко диалектной. Сравнение с однокоренными фамилиями (Фунтиков, Фунтов) показывает, что суффикс -ок в основе (Фунток) — уменьшительная форма, характерная для прозвищ, а не для официальных имён.