По одной из версий, фамилия Фунтусов образована от прозвища Фунтус. В его основе лежит нарицательное «фунт» - «вес в 32 лота или 96 золотников». Возможно, так называли полного человека маленького роста. Однако в восточносибирских говорах существовало выражение «фунтиков толк» - «раскольничий толк беспоповщины». Однако нельзя исключить, что фамилия Фунтусов происходит от латинского слова fundus –«дно», «предел, мера», «земля, земельное владение», «основа». В этом случае она является семинарской: как известно, многим ученикам духовных семинарий присваивали фамилии, образованные от латинских слов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Фунтус, со временем получил фамилию Фунтусов.