Фамилия Габисония, вероятно, образована от древнего кавказского имени Габис, которое предположительно означает «щенок» в переводе с осетинского. В этом случае элемент -он- может представлять собой вариант фамильного суффикса -ани. По другой версии основа фамилии — именование Габисон, которое в переводе с грузинского, вероятно, означает «жеребёнок».