Фамилия Габисов ведет начало от личного мужского имени Габис. В основе этого имени лежит арабский корень, который в переводе означает «злой», «коварный», «гнусный». Однако такое значение не говорит о плохих качествах предка. У многих народов, в том числе и у тюркских, существовала традиция давать детям «охранительные» имена с негативной семантикой. Считалось, что имя-оберег оттолкнет злых духов и нечистую силу, а ребенок, вопреки «плохому» имени, вырастет добрым, благополучным и открытым. Надеясь именно на это, родители могли назвать сына Габисом.

Словообразовательная модель фамилии типична для русской традиции: к основе имени Габис добавили патронимический суффикс -ов. Такая модель указывает на происхождение от отца: «Габисов» буквально означает «сын Габиca» или «потомок Габиca». Это одна из самых распространенных моделей русских фамилий, особенно закрепившаяся в среде дворянства и крестьянства центральной России, но в данном случае фамилия имеет отчетливый тюркский след в основе.

Встречаемость фамилии Габисов невысока, что говорит о ее сравнительной редкости. В основном она фиксируется в регионах с историческим присутствием тюркских народов, например, в Татарстане и Башкортостане, а также в Оренбургской области. С течением времени носители фамилии могли переселяться, поэтому встретить ее можно и в других частях России, но ее географическая привязка к Волго-Уральскому региону остается основной.