Фамилия Габоян — типичный пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян. Эта модель означает «принадлежащий к роду такого-то» или «потомок». В основе фамилии лежит личное имя Габо — армянская форма библейского имени Аарон. В армянском языке имя Аарон претерпело фонетические изменения: через форму Аарон → Гарон → Габо, где произошло закономерное для ряда говоров выпадение «р» и замена «н» на «о». Имя Аарон, в свою очередь, восходит к древнееврейскому «высокий», «гора» или, по другой версии, «просвещённый».

Таким образом, фамилия Габоян буквально означает «потомок Габо», то есть потомок человека по имени Габо. В армянской ономастике такие фамилии указывают на родовую принадлежность: предок носителя фамилии был известен под именем Габо, и его дети или внуки стали называться Габоянами.

Географически фамилия распространена в исторической Западной Армении (ныне территория восточной Турции), особенно в регионе Васпуракан и окрестностях озера Ван. После геноцида армян 1915 года многие носители фамилии расселились по диаспоре: в Армении, России, Сирии, Ливане, США. В России фамилия встречается в Краснодарском крае, Ростовской области и Москве — там, где сформировались крупные армянские общины.

В написании встречаются варианты: Габоян (основной), реже Габоянц — с добавлением русского суффикса -ц, характерного для фамилий, прошедших через русскую канцелярию. В армянском языке фамилия пишется через букву «Г» и не имеет ударения на последнем слоге, как в русском произношении: ударение в армянском падает на предпоследний слог — Габóян.

В отличие от многих русских фамилий, которые могут указывать на профессию или прозвище, Габоян — чисто патронимическая фамилия, и её основное значение — «сын Габо». Если ваш предок носил эту фамилию, то, скорее всего, он был армянским крестьянином или ремесленником из Васпуракана, и его имя Габо передалось как родовой знак через поколения.