Фамилия Гадюкин — редкий случай, когда основа прозвища настолько прозрачна, что сразу вызывает вопрос: за что могли так назвать? Ответ лежит на поверхности: в основе лежит слово «гадюка» — ядовитая змея. Но прозвище Гадюка вряд ли давали человеку со змеиным характером, хотя полностью исключать этого нельзя. Куда вероятнее, что прозвище возникло в среде охотников, рыболовов или крестьян, живших в лесистой местности, где змей было много. Гадюкой могли назвать человека, который умел их ловить, знал, как от них защититься, или, наоборот, случайно наступил на змею и выжил — такой случай запоминался и закреплялся в виде прозвища.

Суффикс -ин указывает на типичную модель русских фамилий, образованных от прозвищ или названий животных, птиц, рыб. Он отвечает на вопрос «чей?»: Гадюкин — значит сын Гадюки, потомок человека с таким прозвищем. Это одна из самых распространённых моделей в северных и центральных губерниях России, так что географически фамилия могла закрепиться в любом регионе, где водились гадюки и где бытовала эта прозвищная традиция.

Есть и более прозаичная версия: Гадюкин могло быть не прозвищем, а охранительным именем. В древнерусской традиции родители намеренно давали ребёнку «плохое» имя — Гадюка, Змей, Урод — чтобы обмануть злых духов и отвести от младенца беду. Считалось, что такого ребёнка нечистая сила не тронет, потому что он и так «плохой». Со временем это имя превратилось в фамилию, потеряв первоначальный смысл.

В фамильных списках Гадюкины встречаются редко. По данным переписей XIX века, носители фамилии жили в основном в южных губерниях — там, где гадюки обычны. Но единичные случаи зафиксированы и на севере, что подтверждает версию об охранительном имени, которое не зависело от места. Сейчас фамилия остаётся малочисленной, но не исчезла — её носители живут в России, на Украине и в странах Балтии.