Фамилия Гафоровы образована от личного имени Гафор (встречается также вариант Гафар). Это имя — аналог арабского Гафур, одного из эпитетов Аллаха в исламе, который переводится как «прощающий», «милующий», «бесконечно милостивый». Называя сына Гафором, родители желали ему покровительства Всевышнего и надеялись, что он вырастет человеком с таким же широким сердцем.

Фамилия строится по простой и распространенной модели: к основе-имени добавляется русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Гафора). Такой способ образования фамилий характерен для многих народов России, в том числе для татар, башкир и других тюркских групп, где личные имена арабского происхождения сочетались с русской фамильной формой.

Фамилия Гафоров встречается в документах. Например, в Книге памяти Мурманской области записан Гафоров Борис Иванович, 1910 года рождения, уроженец станции Медведовская на Кубани. Эта запись интересна тем, что показывает: носитель фамилии жил далеко от традиционных татарских регионов, а его отчество (Иванович) говорит о смешанных или обрусевших корнях семьи уже к началу XX века.

Стоит различать фамилии Гафоров и Гафаров. Обе восходят к одному корню, но вторая образована от более распространенного варианта имени — Гафар. Гафоров — форма более редкая, что может указывать на особенности местного произношения или записи имени в метрических книгах.

Точное время возникновения фамилии назвать сложно — такие фамилии массово закреплялись у татар и башкир в XIX веке после переписей населения. Но отдельные случаи могли быть и раньше. Для установления конкретной родословной нужны архивные поиски по месту жительства предков.