Основой фамилии Гагуа послужило имя Гагу. Фамилия Гагуа образована от мужского грузинского имени Гагу, которое, вероятно, представляет собой грузинский вариант имени Георгий. Имя Георгий в переводе с греческого означает «землепашец». Это имя, по сей день довольно распространённое в Грузии, носили многие грузинские цари. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Гагу, со временем получил фамилию Гагуа.