Фамилия Галипков встречается редко, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она образована от прозвища или имени Галипко, которое, в свою очередь, восходит к уменьшительной форме крестильного имени Галактион. В народной речи это имя нередко сокращали до Галип или Галиха. Суффикс -ко в прозвище Галипко характерен для украинской и южнорусской традиции (как Дмитро → Дмитрик, Иван → Иванько). А фамильный суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Галипка» или «из семьи Галипковых».

Есть и другая, менее вероятная версия: основа могла возникнуть от тюркского имени Галип (от арабского «галиб» — побеждающий, превосходящий). В таком случае фамилия могла появиться в среде крещёных татар или в казачьих родах, где смешивались славянские и восточные имена. Но для фамилии на -ков, распространённой в русских говорах, первая версия с Галактионом выглядит убедительнее, так как тюркские основы обычно дают фамилии на -ов без промежуточного суффикса -к-.

Географически фамилия Галипков тяготеет к югу России — Ростовской области, Краснодарскому краю, а также к Украине. Это подтверждает связь с южнорусской ономастикой, где суффикс -ко в прозвищах был нормой. В документах XIX века носители фамилии могли быть крестьянами или казаками, так как в центральных губерниях фамилия почти не встречается.

Если отбросить редкие варианты, то предок носителя фамилии Галипков, скорее всего, носил прозвище Галипко — возможно, так в быту звали человека по имени Галактион, а потом прозвище закрепилось за его детьми.