Фамилия Галишниковы (в документах чаще встречается в форме единственного числа — Галишников) имеет как минимум две версии происхождения, и обе заслуживают внимания. Первая, более очевидная для русского уха, связывает фамилию с прозвищем Галишник, в основе которого лежит слово «галешник» (или «галечник») — мелкая галька. В старину гальку использовали как балласт для устойчивости судов, поэтому прозвище мог получить человек, занятый её добычей или перевозкой. Реже так называли жителя каменистой местности — того, кто буквально «сидел на гальке».

Вторая версия выводит фамилию из личного имени Галиша, которое, в свою очередь, составлено из двух арабских корней: «Гали» (великий, возвышенный, дорогой) и «Шах» (повелитель, хозяин). Имя с такой семантикой давали с пожеланием ребёнку стать сильным и уважаемым человеком. Эта гипотеза менее распространена, но имеет право на существование, особенно если учесть, что в некоторых регионах России (например, в татарской или башкирской среде) арабские имена входили в состав фамилий через прозвища.

С точки зрения словообразования фамилия построена по типичной русской модели: основа Галишник- + суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Галишника). Суффикс -ник в прозвище мог указывать на род занятий (ср. сапожник, плотник) или на характерный признак. Таким образом, Галишниковы — это потомки человека, которого в округе знали как Галишника.

О точных датах и географии бытования фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько веков, и письменные источники по конкретным прозвищам часто скудны. Тем не менее, фамилия Галишников — памятник живой народной речи, где одно слово могло рассказать и о ремесле предка, и о ландшафте его родных мест.