Фамилия Ганчан — редкая, и её происхождение спорно. Основная версия связывает её с украинским или белорусским прозвищным именем Ганча, которое, в свою очередь, восходит к слову «ганчар» — так на западнорусских землях называли гончара. Суффикс -ан указывает на лицо, связанное с действием или ремеслом: «Ганча» могло означать «тот, кто делает горшки», а сама фамилия Ганчан — «потомок или человек из рода Гончара». В пользу этой версии говорит и география: фамилия встречается в основном на Украине, в частности в Житомирской и Винницкой областях, и в прилегающих районах Беларуси.

Вторая версия, менее распространённая, выводит фамилию от тюркского имени Ганча (уменьшительное от Ган — «кровь» в значении «родной»). Но для славянской ономастики это нетипично: фамилии на -ан в славянской среде почти всегда имеют местное происхождение (Чумак → Чумачан, Швец → Швечан). Поэтому версия с гончарным ремеслом выглядит убедительнее.

Суффикс -ан в фамилии Ганчан — не патронимический (-ович, -енко), а прозвищный. Такая модель образования характерна для украинских и белорусских фамилий, где к основе прозвища добавляли -ан, чтобы указать на человека, связанного с этим занятием или качеством. То есть Ганчан — не «сын Ганчи», а «сам Ганча», но с суффиксом, который закрепился в фамилии. В русских говорах такая форма почти не встречается, что дополнительно указывает на западнорусские корни.

Сословную принадлежность определить сложно: Ганчанами могли быть как вольные ремесленники, так и крепостные крестьяне, занимавшиеся гончарным делом. В документах фамилия не фигурирует среди дворянских родов. Известных носителей с общероссийской известностью нет, что типично для фамилий, образованных от названий ремёсел и бытовавших в среде сельских мастеров.