Фамилия Ганиуллин — яркий пример татарской и башкирской модели образования родовых имён. Её основа — арабское мужское имя Ганиулла, которое в переводе означает «богатство Аллаха» или «изобилие от Аллаха». В исламской традиции имя подчёркивало не материальное, а духовное богатство — щедрость веры и милость Всевышнего.

Словообразовательно фамилия строится по классической тюркской схеме: к имени Ганиулла добавляется русский патронимический суффикс -ин. Получается буквальное значение «сын Ганиуллы» или «потомок Ганиуллы». Такой гибрид арабского корня и русского окончания — типичная история для фамилий народов Поволжья и Приуралья, принявших ислам. Встречаются варианты написания Ганиулов и Ганеуллин, но форма Ганиуллин закрепилась как литературная норма.

Географически фамилия гуще всего представлена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах исторического расселения татар и башкир. Сословно предки носителя фамилии чаще всего относились к государственным крестьянам или тептярям — особому сословию, которое в XVIII–XIX веках платило подати, но не несло рекрутской повинности. Встречаются Ганиуллины и среди купечества, и среди духовенства, но это скорее единичные случаи.

Примечательно, что имя Ганиулла не получило широкого распространения за пределами тюрко-мусульманской среды, поэтому фамилия остаётся этнически маркированной. Если встретили Ганиуллина за Уралом или в Москве — почти наверняка его корни ведут в волжско-уральский регион. В дореволюционных метрических книгах фамилия часто писалась через букву «ѣ» (Ганіуллинъ), что отражало произношение с мягким «н».