Фамилия Гарагулин — одна из тех, где основа говорит больше, чем суффикс. Она явно образована от прозвища или имени Гарагула, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Гарагулы» или «человек из семьи Гарагулы». Суффикс -ин в русских фамилиях обычно крепится к основам на -а, -я, что здесь и происходит. Менее вероятна версия с суффиксом -улин, но в данном случае словообразовательная цепочка проще: Гарагул-а → Гарагул-ин.

Корень «гара-» почти наверняка связан с тюркскими языками, где «кара» (через чередование г/к) означает «чёрный» или «тёмный». Вторая часть «-гул» восходит к тюркскому «kul» — раб, слуга, или к персидскому «гул» — цветок. В сочетании «Карагул» (или «Гарагул») давало значение «чёрный раб» или «тёмный слуга». В тюркской среде такие составные имена были распространены: они не несли унизительного смысла, а скорее указывали на смиренность или принадлежность к роду. В русских говорах, особенно в Поволжье и Приуралье, «кара» легко переходило в «гара» — это диалектная особенность, закреплённая в фамилиях.

По географии фамилия Гарагулин встречается в основном в Оренбургской, Самарской, Челябинской областях, а также в Башкортостане и Татарстане. Это зона активного русско-тюркского пограничья, где оседали казаки, крестьяне и служилые люди. Предки Гарагулиных, скорее всего, были из числа так называемых «служилых татар» или крещёных тюрок, которые переходили на русскую службу и получали фамилии по прозвищам. Не исключено, что прозвище Гарагула мог получить человек с тёмными волосами или смуглой кожей, но первичное значение — именно тюркское имя.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) прямого упоминания Гарагулина нет, но модель «Карагулов/Гарагулин» типична для фамилий тюркского происхождения, адаптированных русским суффиксом. Иногда фамилию путают с Гарагуля — это украинский вариант, где -уля выступает как уменьшительный суффикс, но для Гарагулина тюркская основа надёжнее.

Версия о связи с диалектным русским словом «гарагулить» (говорить невнятно, бормотать) — слабая. Такое слово не зафиксировано в авторитетных словарях, а фамилия встречается именно в регионах с сильным тюркским влиянием. Так что основная линия — от тюркского имени-прозвища, которое со временем закрепилось в русской фамильной форме.