Фамилия Гаткин происходит от названия реки Гатка на Украине или деревни Гатки в Гомельской области Белоруссии. Само слово «гатка» в русских говорах означает настил из брёвен или хвороста на топком месте — прообраз гати. Скорее всего, основатель рода жил в одном из этих мест и получил прозвище по месту жительства.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе «Гатк-» добавили суффикс принадлежности «-ин». В древнерусской традиции суффикс «-ин» указывал на родство или принадлежность: «чей?» — Гаткин, то есть сын человека по прозвищу Гатка.

Написание фамилии встречается и как Гаткин, и как Гаткін — в украинском и белорусском вариантах. В документах XVIII–XIX веков фамилия фиксируется преимущественно в черниговских и могилёвских метрических книгах, что подтверждает её привязку к юго-западным землям Российской империи.

Среди известных носителей — Евгений Яковлевич Гаткин, кандидат медицинских наук, детский хирург и член учёного совета института квантовой медицины. Его деятельность связана с малоинвазивными методами в хирургии, что не имеет прямого отношения к этимологии фамилии, но показывает, что фамилия не «привязана» к какому-то одному сословию или профессии.