Фамилия Гаалкин — редкий случай в русской ономастике, и её написание сразу выдаёт нерусское происхождение. Встречается она в основном у евреев-ашкеназов, и её основа — мужское личное имя Гавриэль или его народная форма Гаврил. В идише это имя звучало как Гаврил, а в некоторых диалектах — как Гаал. Суффикс -ин в русских фамилиях, образованных от имён, указывает на принадлежность: «чей?» — Гаалкин, то есть «сын Гаалки». В данном случае -ин — это не уменьшительный суффикс, а патронимический, по модели «Иван — Иванов, Пётр — Петров, Гаврил — Гаврилов», но в еврейской среде его часто заменяли на -ин (Гаал — Гаалкин, Абрам — Абрамкин).

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Гаа́лкин. В дореволюционной России такие фамилии были типичны для черты оседлости — на территории современных Украины, Беларуси и Польши. Местные писаря, записывая еврейское население, часто русифицировали окончания, заменяя идишские суффиксы на привычные -ов или -ин. Вариант «Гаалкин» мог возникнуть как попытка передать на слух имя Гаал (Гаврил) с добавлением русского патронимического суффикса, но без огласовки «о» (как в Га́врилов). Встречается и более редкая форма — Галкин, но двойное «а» в корне «Гаал» указывает на исходное произношение с долгим гласным, что характерно для некоторых говоров идиша.

Спорных версий о связи с тюркскими или финно-угорскими корнями нет: фамилия чётко привязана к библейскому имени. Единственное, что может сбивать с толку — созвучие с русским словом «галка». Но если бы фамилия происходила от птицы, она писалась бы через одно «а»: Галкин (от галка) или Галкин (от прозвища Галка). Двойное «а» — это фонетическая запись идишского произношения, где имя Га́врил могло редуцироваться до Га́ал или Га́л. Таким образом, Гаалкин — не «птичья», а «именная» фамилия, и её носители — потомки человека по имени Гаал (Гавриэль). Встречаемость фамилии крайне низкая, и в современных российских базах она фиксируется единично, что подтверждает её локальное и диаспоральное происхождение.