Фамилия Гайфулин происходит от мужского имени Гайфула, которое представляет собой сокращённый вариант более полного арабского имени Гайфулла. В основе лежит двухкорневая конструкция: первая часть «гайф» переводится с арабского как «милость» или «милосердие», а вторая — «Улла» — является одним из 99 эпитетов Всевышнего в исламе. Таким образом, имя Гайфулла буквально означает «милость Аллаха», а его краткая форма Гайфула сохраняет тот же смысл.

Фамилия образована по типичной для тюркских народов модели: к основе имени добавляется русский патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («сын Гайфулы»). Такой способ оформления фамилий характерен для татар, башкир и других народов Поволжья, которые в XIX–XX веках массово переходили на русскую фамильную систему. Встречается также вариант написания Гайфуллин — с удвоенной «л», что ближе к исходному арабскому написанию имени (Гайфулла + ин). Оба варианта означают одно и то же.

Географически фамилия распространена преимущественно в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в Средней Азии. В дореволюционной России носители фамилии чаще всего относились к сословию государственных крестьян и мещан, реже — к купечеству или духовенству, поскольку имя Гайфулла было популярно в среде мусульманского духовенства.

Словообразовательная модель показывает, что предок носителя фамилии был назван именем с ярко выраженной религиозной семантикой. Это не прозвище по профессии или внешности, а теофорное имя, данное в надежде на божественное покровительство. Подобные имена (Гайнутдин, Габдулла, Рахматулла) широко бытовали в тюрко-татарской среде, подчёркивая связь человека с исламской традицией.