Фамилия Гайсенков — редкий случай, когда за привычным русским суффиксом -ов скрывается основа, которую не стоит торопиться записывать в исконно славянские. В ней сразу несколько загадок: откуда корень и кем были первые носители.

Начнём с конца. Суффикс -ов (в форме Гайсенков) указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Гайсенков, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Гайсенко. А вот форма Гайсенко — это уже украинская или южнорусская уменьшительная модель с суффиксом -енко, означающая «маленький» или «сын». Значит, предок носителя фамилии, скорее всего, жил на территории современной Украины или в южных русских губерниях, откуда и пришла фамилия в великорусские земли.

Теперь главное — корень Гайс-. Здесь возможны две версии, и обе имеют право на существование. Первая, самая очевидная: основа от имени Гайса. Это могла быть форма крестильного имени, например, Гай — краткая форма от Гавриила или Галактиона, но с характерным украинским окончанием -са (как Ивась, Денис). Вторая версия ведёт к тюркским корням. В тюркских языках «гайса» или «кайса» — одно из имён пророка Иисуса (Иса), известное у татар и башкир. Через посредничество татарской или ногайской знати это имя могло попасть в русскую среду, особенно в южных регионах, где было смешанное население.

Таким образом, фамилия Гайсенков — это не «сын Гайсена», а «сын того, кто был Гайсенко». Первый носитель фамилии, вероятно, был выходцем из малороссийских или южнорусских земель, а его предок носил прозвище или имя Гайса. Спор о происхождении корня — христианское ли это имя или тюркское — остаётся открытым, но в любом случае фамилия отражает сложный культурный пласт, где пересекались славянские, тюркские и православные традиции. Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях России, что подтверждает версию о миграции с юга на север.