Фамилия Гайсенский — яркий пример того, как географическое название превращается в родовое имя. Её основа — топоним Гайсен или Гайсынь. Такие названия встречаются в разных славянских землях, но наиболее вероятный источник — местечко Гайсин на Украине (ныне Винницкая область). В XIX веке это был уездный город, и фамилии на -ский, образованные от названий городов и местечек, чаще всего носили дворяне, получившие «выездную» фамилию по месту службы или владения, а также выходцы из духовенства, бравшие фамилию по месту рождения.

Впрочем, корень «гай» в славянских языках означает «лес», «роща», «дубрава». Поэтому Гайсенским могли назвать человека, жившего у небольшого леса или в селении Гайсынь, которое получило имя от этого природного признака. Суффикс -ск- указывает на принадлежность или происхождение: Гайсенский — буквально «тот, кто из Гайсена (Гайсина)».

Если заглянуть в исторические документы, фамилия фиксируется в основном на территории бывшей Речи Посполитой и Российской империи, в Подольской и Волынской губерниях. Встречается она и в польском написании Gajseński, что подтверждает её шляхетское происхождение — среди мелкой польской и украинской шляхты такие фамилии были распространены.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий Гайсин или Гайский, окончание -енск-ий встречается реже, что делает фамилию Гайсенский более локальной и привязанной к конкретному поселению, а не к нарицательному «гай». Если предки носителя фамилии были не из Гайсина, то, возможно, прозвище Гайсена (от «гай» с уменьшительным суффиксом) дали человеку, жившему в небольшом лесном хуторе.