Фамилия Гданьян — редкий для русского уха случай, когда в основе лежит не имя, не прозвище и не ремесло, а географическое название конкретного города. Её носитель почти наверняка происходит из семьи, чей предок был родом из Гданьска — крупного портового города на севере Польши. В русском языке название города долгое время бытовало в форме «Гданьск», но в польском звучит как Gdańsk, отсюда и корень «Гдань-». Суффикс «-ян» — типичный восточноармянский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность (ср. Арутюнян, Петросян). Таким образом, Гданьян — это «из Гданьска» или «гданьский».

С точки зрения словообразования, фамилия необычна сочетанием славянского топонима с армянским формантом. Это говорит о том, что предок носителя, вероятно, был армянином, жившим или родившимся в Гданьске, либо его семья переселилась оттуда. В Российской империи армянские диаспоры существовали во многих торговых городах Европы, и Гданьск, как крупный балтийский порт, был одним из центров армянской торговли в XVII–XVIII веках. Поэтому фамилия могла закрепиться за купеческим родом, который вёл дела через этот город.

Других версий происхождения, например от личного имени или прозвища, для этой фамилии нет — основа слишком конкретна и прозрачна. В отличие от фамилий вроде Гданьский (типичная польская или русская модель на -ский), суффикс -ян сразу выдает армянский след. Встречается фамилия крайне редко, в основном в среде армянской диаспоры постсоветского пространства. Если вы носите эту фамилию, ваши корни почти наверняка ведут к армянскому купеческому или ремесленному роду, связанному с Гданьском — городу, который в польском языке до сих пор сохраняет древнее название, а в вашей фамилии — память о нём.