Фамилия Гертнер ведет свое начало от аналогичного прозвища, в основе которого лежит немецкое слово Garte - «сад». Можно предположить, что прозвище Гертнер относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятии предка. Скорее всего, основатель рода Гертнер был садовником или виноторговцем. Фамилия Гертнер распространена также у евреев.