Фамилия Гилькарова — редкий пример, где географический и языковой следы почти не оставляют сомнений в происхождении. Её основа — Гилькар — с высокой вероятностью восходит к тюркскому или иранскому личному имени, в котором угадываются компоненты «гиль» (цветок, роза) и «кар» (работа, дело, или же «гора», «скала» в некоторых диалектах). Такая двусоставная модель типична для мусульманских имён Средней Азии и Поволжья: Гилькар могло означать «роза дела» или «тот, кто подобен цветку» — прозвище, данное с пожеланием красоты и успеха.

Суффикс -ова указывает на принадлежность: Гилькарова — это «дочь/жена Гилькара». Мужская форма, Гилькаров, образована по стандартной русской модели от тюркского имени, что говорит о давних контактах: носитель фамилии или его предок перешёл в русскоязычную среду, и его имя оформили по правилам русской грамматики. Подобные фамилии нередки среди татар, башкир, азербайджанцев, а также народов Дагестана, где суффикс -ов стал массовым в XIX веке при записи в метрики.

В отличие от фамилий на -ин или -ский, которые часто привязаны к конкретной местности, Гилькарова — продукт канцелярской унификации: имя Гилькар записали «под копирку» с окончанием на -ов, не задумываясь о значении. Это типично для южных и восточных регионов Российской империи, где русские чиновники адаптировали местные имена. Если искать параллели, то можно вспомнить фамилии Гильманов, Гильфанов — с тем же корнем «гиль» (цветок), но с разными вторыми частями. Гилькарова стоит особняком: она почти не встречается в центральных областях России, что подтверждает её локальное, скорее всего, поволжское или северокавказское происхождение.

О сословной принадлежности сказать что-то определённое трудно. Имя Гилькар не было княжеским или духовным — скорее, его носили крестьяне, ремесленники или мелкие торговцы. В XX веке фамилия могла закрепиться за потомками тех, кто переехал в города, сменил среду, но сохранил родовое имя в паспорте. Сегодня Гилькарова — одна из тех фамилий, по которой можно безошибочно определить регион предков: если не Средняя Азия, то южный Урал или Закавказье.