Фамилия Гиллер — один из тех случаев, где на стыке языков и культур рождается несколько версий происхождения, и каждая по-своему убедительна. Начнём с самой распространённой: Гиллер — это фонетический вариант немецкой фамилии Хиллер. Под влиянием русского языка звук [х] в заимствованных словах часто заменялся на [г], так и появилось привычное нам написание. Исходное же прозвище Хиллер, в свою очередь, восходит к верхненемецкому слову hülle — «мантия, плащ, накидка». Скорее всего, так называли портного, мастера по шитью верхней одежды. Но не исключён и переносный смысл: «укутанный», «закрытый» — то есть человек скрытный, необщительный, нелюдимый. Такая семантика встречается в прозвищах многих народов.

Есть и другая, совсем иная по духу гипотеза. Она выводит фамилию из идиша: слово gil означает «радость, счастье, восторг». В этом случае предок рода Гиллер мог быть человеком жизнерадостным, весельчаком, получившим прозвище по своему характеру. Обе версии не противоречат друг другу — они просто относятся к разным ветвям носителей фамилии. Германская основа и формант -ер указывают на ашкеназские корни, что подтверждается и документальными свидетельствами.

В Книгах памяти разных областей бывшего СССР фамилия встречается и у евреев, и у немцев. Например, в Алма-Атинской области записан еврей Леонид Александрович Гиллер (1919 г.р., уроженец Краснограда Харьковской области), в Вологодской — Михель Яковлевич Гиллер (1885 г.р., из польского Вышогруда). А в Акмолинской области фигурируют немцы: Фридеберт Людвигович Гиллер из Винницкой области и Фридрих Иванович Гиллер (1899 г.р.) из Киевской. Есть и варшавский еврей Шмуля Гиршевич Гиллер (1935 г.р.) в Книге памяти Архангельской области. Среди известных носителей — немецкий композитор Иоганн-Адам Гиллер (1728—1804) и польский журналист и историк Агатон Гиллер (1831—1887). Таким образом, фамилия объединяет разные линии: немецкую портновскую, еврейскую «радостную» и, возможно, другие, утраченные со временем.