Фамилия Галлер чаще всего восходит к латинскому имени Галл (Gallus), которое переводится как «петух». В римской истории это имя носил император Гай Вибий Требониан Галл, правивший в 251–253 годах нашей эры. Его короткое правление было неспокойным: военная угроза на границах усилилась, а сам Галл, избегая сражений, потерял доверие армии и в итоге был убит солдатами. Именно от этого латинского корня, вероятно, и пошла фамилия.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию со средневерхненемецким словом galle — «горечь» или «желчь». В таком случае прозвище Галлер могли дать человеку с язвительным или желчным характером. Словообразовательная модель здесь простая: основа без изменений плюс суффикс -ер, типичный для немецких фамилий, указывающий на носителя признака или профессию.

Среди известных носителей фамилии — Альбрехт фон Галлер (1708–1777), швейцарский анатом, физиолог, естествоиспытатель и поэт. Его имя закрепило за фамилией научный и культурный вес, хотя в бытовом плане Галлеры могли быть и простыми ремесленниками, и крестьянами — всё зависит от региона. В немецкоязычных землях фамилия встречается с XIII века, а в России могла появиться через балтийских немцев или переселенцев эпохи Екатерины II.