Фамилия Гиниатов — редкая и с неочевидной на первый взгляд основой. Если отбросить типичный русский фамильный суффикс -ов (указывающий на принадлежность: «чей?» — сын Гиниата), остаётся личное имя или прозвище Гиниат. Именно в нём и кроется главная загадка.

Наиболее вероятное объяснение ведёт нас в тюркскую или арабо-мусульманскую среду. Имя Гиниат может быть русифицированной формой арабского имени Хинаят (или Гыйнаят), что значит «забота», «попечение», «милость». В татарской и башкирской традиции такие имена были распространены, а на стыке с русским делопроизводством звук «х» часто заменялся на «г», а окончание адаптировалось: Хинаят → Гиният → Гиниат. Соответственно, родоначальник Гиниатовых — человек, носивший это имя, вероятно, из числа служилых татар, торговцев или крестьян Поволжья и Приуралья.

Суффикс -ов, а не, скажем, -ин, подсказывает, что основа оканчивалась на согласный (Гиниат, а не Гиня). Это дополнительно указывает на заимствованный корень: в исконно русских именах на -а/-я мы бы получили фамилию Гинятов. Встречается также вариант написания Гиниятов, что закрепляет связь с исходным «Хинаят».

География фамилии подтверждает эту версию. Гиниатовы встречаются преимущественно в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях — там, где исторически жили тюркоязычные народы, принимавшие православие или сохранявшие мусульманские имена в русской записи. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия могла фиксироваться у крещёных татар (кряшен) или у башкир, перешедших в православие, но менявших имя лишь формально.

Менее правдоподобная, но возможная версия — связь с греческим именем Геннадий через его уменьшительную форму Гина. Однако для этого пришлось бы допустить нехарактерный переход «Гина» → «Гиниат» с наращением -ат, что для русской ономастики нетипично. Так что тюркский след остаётся главным.