Фамилия Глазиус звучит не по-русски и сразу бросается в глаза своим латинским окончанием -ус. Это типичный признак фамилий, которые получали выпускники духовных семинарий и академий в Российской империи. С середины XVIII века и особенно в XIX веке семинаристам при поступлении или окончании учёбы нередко меняли бытовые русские фамилии на более благозвучные, книжные, часто латинизированные. Так появились целые пласты фамилий вроде Сперанский (от лат. spero — надеюсь), Бенедиктов или Кусто́диев. Глазиус, скорее всего, образована от той же основы, что и русская фамилия Глазов или прозвище Глаз.

Основа здесь — «глаз». Вероятнее всего, семинарский наставник или сам будущий священник переделал русскую фамилию Глазов (или однокоренную ей) в латинскую форму. По-латыни «глаз» — oculus, но напрямую Окулюс в русской семинарской среде не прижился. Фамилия Глазиус, скорее всего, искусственная «латинизация» на базе русского корня с добавлением типичного латинского суффикса -ius. Такая операция была распространена: брали русскую основу и приделывали к ней латинское окончание, чтобы фамилия звучала «учёно». Прямых аналогов с корнем «глаз» в классической латыни нет, поэтому версия о переделке из русского — самая правдоподобная.

Вторая, менее вероятная версия — происхождение от польского или западнорусского прозвища, где «глазиус» могло быть ироничным обозначением человека с большими или зоркими глазами. Однако польские фамилии на -ус обычно имеют другую природу (например, Янус, Матеуш), и для них характерно ударение на предпоследний слог, тогда как в русской семинарской традиции ударение часто ставили на корень — Гла́зиус. Поэтому семинарское происхождение выглядит убедительнее.

Носители фамилии Глазиус — это почти наверняка потомки людей, связанных с духовным сословием: священников, дьяконов, псаломщиков или их детей, получивших образование в семинарии. Фамилия редкая, и её география, скорее всего, привязана к центральным губерниям России, где располагались крупные семинарии (например, Московская, Тверская, Ярославская). Встретить Глазиусов среди крестьян или купцов почти невозможно — это маркер книжной, церковной среды.

Отдельного внимания заслуживает написание. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла фиксироваться по-разному: Глазиусъ, реже — Глазiусъ. После реформы орфографии 1918 года твёрдый знак и «i» исчезли, и фамилия приобрела современный вид. Встречается также вариант Глазиуз, но он ошибочен и, вероятно, появился из-за неверного прочтения рукописного текста.