Фамилия Глубникова — женская форма от Глубников, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов(-а) указывает на принадлежность: Глубников — «сын Глубника» или «из дома Глубника». Основа здесь — прозвище Глубник. Что оно могло значить? Самый прямой путь — от слова «глубина». В русских говорах «глубник» нередко называли человека, который живёт в глухом, удалённом месте, в глубинке, в лесу или овраге. Второй вариант, более конкретный: в псковских и тверских говорах «глубник» — это родник, ключ, бьющий из глубины. Тогда прозвище мог получить человек, живший у такого родника или владевший участком с ним. Третий, менее вероятный, но возможный — от «глубокий» как характеристика ума или голоса, но для прозвищ такое встречается реже.

Интересно, что фамилия Глубников не входит в число самых распространённых, но имеет чёткую географическую привязку. По данным современных исследований, её ядро — центральные и северо-западные области России: Тверская, Псковская, Новгородская, отчасти Вологодская. Это как раз те регионы, где слово «глубник» в значении «родник» зафиксировано диалектологами. Так что, скорее всего, предки носителей фамилии жили не на равнине, а у лесных ключей или в глухих деревнях.

С точки зрения словообразования, фамилия редкая тем, что основа на -ник не так часто переходит в фамилию напрямую, без промежуточного отчества. Обычно -ник даёт фамилии вроде Сапожников или Мельников, где прозвище уже было профессией. Здесь же прозвище — чисто географическое или бытовое. Сравните с однокоренными: Глубоков — от прилагательного «глубокий» (чаще о реке или овраге), Глубинин — от «глубина», а Глубников — именно от существительного-прозвища. Это отличает её от более частых аналогов.

В сословном плане Глубниковы, скорее всего, были крестьянами или мещанами. В дворянские роды с такой фамилией не входили, да и в купеческих списках XIX века она почти не встречается. Фамилия не аристократическая, а народная, что подтверждает её происхождение от бытового прозвища. Единственное, что можно добавить: ударение, судя по устойчивой традиции, падает на первый слог — Глу́бников, а не Глубнико́в, что тоже характерно для фамилий от двусложных основ с корнем «глуб-».