Фамилия Глубова — женская форма фамилии Глубов, а та образована от прозвища или нецерковного имени Глуб. В отличие от похожих по звучанию фамилий (Глубоков, Глубинин), основа здесь короче, без суффикса -ок-, что сразу указывает на иную модель: Глуб — это не «глубокий», а, скорее всего, прозвище, данное за манеру говорить глухо, невнятно. В северных и сибирских говорах слово «глу́бый» означало «глуховатый, тугой на ухо»; отсюда же и глагол «глу́бнуть» — оглохнуть. Прозвище Глуб могли дать человеку с плохим слухом, который постоянно переспрашивал или говорил слишком громко.

Патронимический суффикс -ов стандартен для русских фамилий, образованных от имен и прозвищ на твердый согласный. Таким образом, Глубов — буквально «сын Глуба». Фамилия редкая, нечастотная, что объясняется диалектным происхождением: она почти не встречается за пределами Архангельской, Вологодской и Кировской областей, где слово «глуб» бытовало в живой речи.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Глуба от слова «глубить» — делать углубление, рыть яму. Тогда предок мог быть землекопом или колодезником. Однако эта гипотеза слабее: в русской ономастике фамилии от глагольных основ с таким суффиксом почти не образуются, а прозвища по профессии обычно оформлялись иначе (Землекопов, Рытов). Поэтому версия с глухотой — основная.

Фамилия Глубова, как и её мужской вариант, не имеет отношения к знаменитым дворянским родам. Это крестьянская или посадская фамилия, возникшая не позднее XVII века, когда прозвища стали наследственными на Русском Севере. Встречается она и сегодня, но в основном среди потомков северных переселенцев в Сибири и на Урале.