Фамилия Годжатов — редкий пример, где прозвищная основа почти наверняка не русская, а тюркская или кавказская. Суффикс -ов указывает на то, что фамилию «обрусели» по стандартной модели: к основе Годжат добавили русский патронимический суффикс, означающий принадлежность («чей?» — Годжатов). Значит, предка звали Годжат — и это было его личным именем или прозвищем.

Самое правдоподобное объяснение: имя Годжат восходит к тюркскому «годжа» (или «ходжа», «коджа») — «господин», «хозяин», «наставник», «старейшина». В мусульманской среде ходжами называли уважаемых людей, потомков пророка или просто богатых купцов и землевладельцев. Форма Годжат могла возникнуть как местный диалектный вариант (например, в азербайджанском или кумыкском произношении). Тогда носитель фамилии — потомок человека, которого в округе звали Годжатом, то есть «господином» или «старшим».

Менее вероятная, но возможная версия: связь с арабским «гази» (воин за веру) или с тюркским «гёджа» (ночь, тёмный). Но первая версия — с «ходжой» — встречается в фамилиях гораздо чаще и объясняет уважительный оттенок прозвища. Географически фамилия Годжатов тяготеет к южным регионам России и Северному Кавказу, где веками жили тюркские и кавказские народы, принимавшие православие и адаптировавшие свои имена под русские фамильные суффиксы.

Таким образом, Годжатовы — это, скорее всего, потомки человека по прозвищу Годжат, что означало «уважаемый старейшина» или «господин». Сословная принадлежность могла быть разной: от зажиточного крестьянина до мелкого торговца. В дворянских родословных книгах фамилия не засветилась, так что, вероятнее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в XIX веке при массовом закреплении фамилий за бывшими крепостными.