Фамилия Гоебенькова — один из тех редких случаев, когда написание сразу бросается в глаза необычным сочетанием «ое» в корне. Это не случайная описка и не иноязычное заимствование, а живая примета севернорусского говора. Перед нами так называемое «ёкающее» произношение, закреплённое на письме: в диалектах Архангельской, Вологодской областей и частично в Сибири (куда уходили переселенцы) звук [о] после мягкого согласного могли произносить и писать как «ё», а в безударном положении — как «е». Исходная форма фамилии — Гобенькова, где корень тот же, что в слове «гобь» или «гобза».

«Гобза» в древнерусском языке означала «копилка», «казна», «богатство», а «гобзина» — «обилие», «изобилие». Отсюда пошло и прозвище Гобень — так могли назвать человека зажиточного, удачливого в хозяйстве или, напротив, скупого, копящего добро. Слово было широко распространено в новгородских и псковских землях, а оттуда — на Север. Суффикс -ень в прозвище (как в «тюлень», «олень») придавал оттенок ласкательности или уменьшительности. Таким образом, Гобень — это не просто «богач», а скорее «богатенький», «копеечник», «тот, кто копит».

Фамилия образована по классической притяжательной модели: Гобень → Гобеньков (чей? — сын или внук Гобеня) → Гобенькова (женская форма). Женский вариант закрепился как фамилия либо по мужу, либо по отцу в тех семьях, где в документах записывали женщин. Суффикс -ов- указывает на принадлежность, а окончание -а — на женский род. Встречается и мужская форма Гоебеньков (с тем же диалектным «ое»), но в современном русском языке в паспортах и документах чаще фиксируют именно женский вариант как самостоятельную фамилию.

С географической точки зрения фамилия редкая. Основные очаги — Архангельская область (особенно бывшие Онежский и Холмогорский уезды) и Вологодчина. Встречаются единичные носители в Сибири, что подтверждает версию о переселении северных крестьян в XIX — начале XX века. Сословно предки Гоебеньковых — скорее всего государственные крестьяне, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

В написании возможна путаница: в старых метрических книгах фамилию могли записать как «Гобенькова» (без «е» после «г») или «Гобинькова». Вариант «Гоебенькова» — результат того, что диалектное произношение пересилило орфографическую норму. Сегодня это одна из тех фамилий, которые позволяют лингвисту безошибочно определить северное происхождение рода.