Фамилия Гогуненко звучит как типичная украинская фамилия, и это верное первое впечатление. Она образована по распространённой в Украине и Беларуси модели с суффиксом -енко, который в XVI–XVII веках означал «сын» или «потомок». То есть Гогуненко — это буквально «сын Гогуна». Вся загадка фамилии упирается в прозвище Гогун.

Самая вероятная версия происхождения основы — от украинского или южнорусского диалектного слова «гогун». В говорах так называли человека, который издаёт глухие, невнятные звуки, бормочет, или же того, кто имеет привычку гоготать, то есть громко и резко смеяться. Слово «гогот» и родственные ему «гоготать», «гоголь» (птица, издающая характерный звук) образуют гнездо звукоподражательных слов. Прозвище Гогун мог получить либо говорун с необычной манерой речи, либо, наоборот, молчун, чьё бормотание казалось окружающим забавным. В ономастике такие прозвища по поведению или голосу — один из самых частых источников фамилий.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с названием птицы гоголь. В этом случае Гогун могло быть ласкательной или уменьшительной формой прозвища «Гоголь», которое давали человеку за важную походку, характерную внешность или привычку носить пёструю одежду. Однако суффикс -ун в украинских прозвищах чаще указывает на деятеля или носителя признака (бегун, крикун), чем на уменьшительность, поэтому версия с птицей менее убедительна.

Географически фамилия Гогуненко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкасщине. Это регионы, где суффикс -енко исторически доминировал, вытеснив великорусские -ов и -ин. В России фамилия встречается редко и почти всегда указывает на украинские корни семьи. Интересно, что в XIX веке носители фамилии часто записывались как Гогуненков, подгоняя украинское окончание под русскую бюрократическую норму, но впоследствии многие вернули исходную форму.

Сословного барьера фамилия не имела. Её носили и казаки, и крестьяне, и мещане. В реестрах Запорожского войска XVII века встречаются люди с прозвищем Гогун, что подтверждает древность основы. Таким образом, Гогуненко — это фамилия-характеристика, которая закрепила за предком его речевую особенность или манеру поведения.